用于一般物体表面消毒、环境消毒、空气消毒、饮用水消毒、饲料消毒。

对于口蹄疫、禽流感、新城疫、猪瘟、牛肺疫、鸭瘟、兔瘟、禽霍乱、鸡白痢大肠杆菌、沙门氏菌等病毒性、细菌性疾病都能有效，并有去污、除腥、除臭之功能。

二氧化氯具有双重氧化作用。能吸附和穿透生物表面进入内部，有效地破坏酶系统，导致微生物代谢机能障碍而死亡。它不像甲醛、戊二醛和酚类化合物等使微生物蛋白质变性而失去活性；它也不像氯气、漂白粉、次氯酸钠等与水中有机物作用产生有致癌作用的游记绿衍生物（如：氯仿、氯胺等）。二氧化氯灭菌消毒不产生抗药性，也不受水体ph值的影响，对高等动物结构无任何毒害，因而是绿色消毒剂。